1、北京地坛医院的前身是1938年日本大使馆由世界红十字中华总会购得院址（大佛寺西街十一号）房舍后拨作日本同仁医院第二分院。

2、1945年10月15日当时市政府接收后改称北平市立第三医院分院，同年11月1日改称北平市立肺病疗养院。

3、1946年3月1日在东城区宽街大佛寺西街十一号旧址，奉令改组为北平市立传染病医院，设有病床100张，工作人员59人，是北京市最早的一所传染病专科医院。

4、1947年5月6日北平市立传染病医院附设结核疗养所。

5、1949年北平解放，军管会派军代表刘敏、魏侠等五位同志接管北平市立传染病医院，建国后改名为北京市传染病医院。

6、1950年抗美援朝开始后，大佛寺旧址开始收治朝鲜战争中受伤的伤员，北京市传染病医院迁址到东城区安定门外地坛公园西门13号。全院有平顶病房八排，分为五个病区，150张病床。

7、1959年北京市为加强传染病防治力量，在南城又成立了一所传染病医院，医院被命名为北京第一传染病医院。

8、1965年至1966年北京第一传染病医院与北京市卫生防疫站合并。

9、1969年12月北京第一传染病医院接到了上级指示，遵照毛主席“6.26”指示医院要全部迁到甘肃。

10、1970年，全院职工300多人，分布在甘肃8个县，为甘肃人民的医疗工作做出贡献。

11、1973年2月在东城区安定门外地坛公园西门13号原址重新组建北京第一传染病医院。

12、1989年6月12日更名北京地坛医院。

13、1997年1月29日，在卫生部首批医院等级评审中，北京地坛医院成为三级甲等医院。

14、2008年9月24日医院朝阳区京顺东街8号新址全面投入使用，为北京市公共卫生救治体系的发展添上了浓浓一笔。

15、2011年3月医院成为首都医科大学附属北京地坛医院及首都医科大学第十二临床医学院。

16、2012年5月11日在原潮白河骨伤科医院举行地坛医院接收潮白河骨伤科医院大会。市医管局领导宣布了“关于首都医科大学附属北京地坛医院接收北京潮白河骨伤科医院的决定”，原潮白河骨伤科医院成为地坛医院顺义院区。

17、2021年4月16日获批国家传染病医学中心。

18、2024年1月6日，国家区域医疗中心建设项目—首都医科大学附属北京地坛医院徐州医院正式揭牌。